应用程序可通过ODBC或ADO方式，经由使用MyODBC与MySQL数据库连接。
MS .Net Framework 下的程序（例如：C#、VB.NET）可通过ADO.NET的方式，经由使用MySQL.Net与MySQL数据库连接。
C／C++ 可使用 / mysql 或是直接使用 MySQL自带之API 与MySQL数据库连接。
PHP可通过PHP的MySQLi与MySQL数据库连接，具备比mysql模块更好的性能。另外PHP6可使用mysqlnd与MySQL数据库连接。
JAVA程序可通过JDBC方式与mysql进行连接，mysql官方提供了JDBC驱动程序。
可通过mysql客户端软件与mysql进行连接，如mysqlfront, mysqlyog, mysqlbrowser等。